32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0865 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0865  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  341  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5655  hypothetical protein  83.43 
 
 		 177 aa  266  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3874  hypothetical protein  45.66 
 
 		 175 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2371  hypothetical protein  44.03 
 
 		 182 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0935  hypothetical protein  41.01 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.496148  normal  0.761399 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3765  hypothetical protein  42.13 
 
 		 198 aa  91.3  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0618918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1724  hypothetical protein  38.55 
 
 		 174 aa  89.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443827  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1491  hypothetical protein  40.38 
 
 		 184 aa  84.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29220  protein of unknown function (DUF2017)  36.41 
 
 		 185 aa  84.7  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.942758  normal  0.431311 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1695  hypothetical protein  36.52 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185996  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3926  hypothetical protein  37.11 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.985377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3852  hypothetical protein  37.11 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0988  hypothetical protein  43.09 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278461  normal  0.303864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3838  hypothetical protein  37.11 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0721345  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1099  hypothetical protein  43.09 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.623925  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2316  hypothetical protein  36.96 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000075431 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2584  hypothetical protein  35.48 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000122661  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1006  hypothetical protein  33.51 
 
 		 185 aa  72  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780874  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2740  hypothetical protein  30.69 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1308  hypothetical protein  32.46 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1322  Domain of unknown function DUF2017  44.27 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.134617  hitchhiker  0.00216166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1870  hypothetical protein  34.95 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0087636  normal  0.127946 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1690  hypothetical protein  36.94 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0379903  hitchhiker  0.00000515175 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4295  hypothetical protein  34.93 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1961  hypothetical protein  33.14 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2350  hypothetical protein  32.19 
 
 		 194 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.394519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1354  Domain of unknown function DUF2017  38.98 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1288  Domain of unknown function DUF2017  37.08 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347664  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11364  transcriptional regulator  35.34 
 
 		 218 aa  52  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000273911  normal  0.357351 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1057  hypothetical protein  34.68 
 
 		 222 aa  48.5  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20080  protein of unknown function (DUF2017)  29.11 
 
 		 211 aa  48.1  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0919227  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08340  hypothetical protein  31.67 
 
 		 255 aa  45.4  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>