22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0205 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0205  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  805    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6754  lanthionine synthetase C family protein  67.86 
 
 		 358 aa  318  7.999999999999999e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3997  hypothetical protein  63.84 
 
 		 242 aa  202  9e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.366143  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3314  hypothetical protein  49.13 
 
 		 381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.111602 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1126  lanthionine synthetase C-like  44.33 
 
 		 405 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1333  lanthionine synthetase C family protein  49.44 
 
 		 436 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2800  lanthionine synthetase C family protein  46.27 
 
 		 399 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0603  lanthionine synthetase C family protein  47.94 
 
 		 420 aa  173  5.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3937  Lanthionine synthetase C family protein  41.75 
 
 		 367 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207083  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0055  lanthionine synthetase C family protein  43.28 
 
 		 395 aa  157  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4648  Lanthionine synthetase C family protein  41.92 
 
 		 390 aa  153  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2032  hypothetical protein  46.21 
 
 		 412 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1822  hypothetical protein  43.06 
 
 		 408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.961315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5418  Lanthionine synthetase C family protein  37.39 
 
 		 409 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3531  hypothetical protein  46.62 
 
 		 427 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0966276  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3603  Lanthionine synthetase C family protein  36.21 
 
 		 409 aa  86.7  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4144  Lanthionine synthetase C family protein  30.99 
 
 		 491 aa  57.4  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.732259  normal  0.0439523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3102  Lanthionine synthetase C family protein  32.52 
 
 		 466 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.220551 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1439  Lanthionine synthetase C family protein  27.73 
 
 		 404 aa  53.1  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0555  Lanthionine synthetase C family protein  23.98 
 
 		 409 aa  47.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4705  Lanthionine synthetase C family protein  30.11 
 
 		 414 aa  46.6  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4693  Lanthionine synthetase C family protein  30.22 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205081  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>