18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4849 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4849  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  844    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05140  hypothetical protein  32.4 
 
 
366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1369  hypothetical protein  32.2 
 
 
366 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.429385  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0093  hypothetical protein  27.65 
 
 
361 aa  132  9e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6603  hypothetical protein  31.86 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0592  hypothetical protein  29.54 
 
 
368 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.60475  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0611  hypothetical protein  28.02 
 
 
375 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0811954 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0720  hypothetical protein  26.96 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1867  hypothetical protein  26.79 
 
 
449 aa  103  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308254  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1597  hypothetical protein  24.93 
 
 
369 aa  95.5  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.509379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5988  hypothetical protein  22.82 
 
 
475 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075136  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3719  hypothetical protein  22.16 
 
 
483 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1247  hypothetical protein  23.33 
 
 
560 aa  73.6  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.477424  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3759  hypothetical protein  22.63 
 
 
461 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7754  hypothetical protein  25 
 
 
466 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.904748  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2547  hypothetical protein  27.35 
 
 
627 aa  68.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256267  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7173  hypothetical protein  26.62 
 
 
580 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142604  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1604  hypothetical protein  24.4 
 
 
452 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.523133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>