28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0947 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0947  primosomal replication protein N''  100 
 
 
175 aa  350  5e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.815884  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0541  primosomal replication protein N''  56.57 
 
 
175 aa  199  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0525  primosomal replication protein N''  56.57 
 
 
175 aa  198  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0522  primosomal replication protein N''  55.56 
 
 
171 aa  191  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0585  primosomal replication protein N''  55.56 
 
 
171 aa  191  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394207  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0531  primosomal replication protein N''  55.56 
 
 
171 aa  191  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3143  Primosomal replication priB and priC  55.43 
 
 
175 aa  179  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00423  hypothetical protein  55.43 
 
 
175 aa  179  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0862408  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0399  primosomal replication protein N''  55.43 
 
 
175 aa  179  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.436694  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0503  primosomal replication protein N''  55.43 
 
 
175 aa  179  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.151762  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00418  primosomal replication protein N''  55.43 
 
 
175 aa  179  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0764995  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3149  primosomal replication protein N''  55.43 
 
 
175 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119522  normal  0.373691 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0544  primosomal replication protein N''  55.43 
 
 
175 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0510  primosomal replication protein N''  54.29 
 
 
175 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00536071  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0557  primosomal replication protein N''  53.71 
 
 
175 aa  174  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0959641  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3043  Primosomal replication priB and priC  43.02 
 
 
177 aa  125  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1132  primosomal replication priB and priC  42.77 
 
 
178 aa  121  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1073  Primosomal replication priB and priC  41.04 
 
 
178 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0102132  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1015  Primosomal replication priB and priC  41.86 
 
 
178 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.265941  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3238  Primosomal replication priB and priC  39.31 
 
 
178 aa  114  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104789  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2885  primosomal replication protein n''  38.07 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0303464 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3202  primosomal replication priB and priC  38.07 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3062  primosomal replication protein n''  38.07 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1127  primosomal replication protein N''  28.57 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003965  primosomal replication protein N''  32 
 
 
181 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0128436  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01555  primosomal replication protein N''  31.33 
 
 
181 aa  52.4  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3758  putative primosomal replication protein N''  29.38 
 
 
227 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1448  primosomal replication protein N``  29.41 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000618679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>