15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0374 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0374  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  626  1e-178  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2305  hypothetical protein  40 
 
 
242 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310483  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13170  VTC domain-containing protein  41.55 
 
 
284 aa  175  9e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.733284 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03580  VTC domain-containing protein  37.41 
 
 
318 aa  155  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.102393 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0240  hypothetical protein  32.47 
 
 
260 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.659958  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1595  hypothetical protein  23.86 
 
 
228 aa  52  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00605594 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0249  hypothetical protein  24.14 
 
 
228 aa  50.1  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1555  hypothetical protein  24.9 
 
 
231 aa  49.7  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0170408  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32880  predicted protein  21.99 
 
 
614 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0701  hypothetical protein  26.56 
 
 
224 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2978  hypothetical protein  26.49 
 
 
227 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1407  hypothetical protein  23.26 
 
 
228 aa  46.2  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3014  hypothetical protein  27.59 
 
 
243 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4918  hypothetical protein  23.4 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2178  hypothetical protein  23.19 
 
 
228 aa  43.1  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>