33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3102 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_3102  putative carboxylase  100 
 
 		 271 aa  550  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0594  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  550  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153196  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0621  hypothetical protein  99.26 
 
 		 271 aa  545  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.492624  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3093  putative carboxylase  99.26 
 
 		 271 aa  545  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0558  hypothetical protein  97.79 
 
 		 271 aa  540  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0684947  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00475  hypothetical protein  98.52 
 
 		 271 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0565  hypothetical protein  97.42 
 
 		 271 aa  537  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.474357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0454  hypothetical protein  97.05 
 
 		 271 aa  535  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0103919  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00470  hypothetical protein  98.74 
 
 		 239 aa  478  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0577  putative cytoplasmic protein  65.43 
 
 		 269 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.463481  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0584  putative cytoplasmic protein  65.43 
 
 		 269 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0954621 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0639  hypothetical protein  65.27 
 
 		 262 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.31539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0579  hypothetical protein  65.27 
 
 		 262 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0581  hypothetical protein  42.86 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6673  hypothetical protein  36.72 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148245  normal  0.182212 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2233  hypothetical protein  34.65 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.143209 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0786  hypothetical protein  25.53 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0410  hypothetical protein  36.7 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2970  hypothetical protein  31.47 
 
 		 331 aa  53.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00184088  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2123  hypothetical protein  31.3 
 
 		 302 aa  52.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3107  hypothetical protein  33.06 
 
 		 336 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.921908  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00275  hypothetical protein  25.94 
 
 		 287 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00278  hypothetical protein  25.94 
 
 		 287 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0350  hypothetical protein  25.95 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0380  hypothetical protein  25.56 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0338  hypothetical protein  25.56 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3287  conserved hypothetical protein  25.56 
 
 		 287 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3304  hypothetical protein  25.56 
 
 		 287 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0383  hypothetical protein  25.28 
 
 		 287 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.370097 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03715  conserved hypothetical protein  31.82 
 
 		 286 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03664  hypothetical protein  31.82 
 
 		 286 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4202  hypothetical protein  31.82 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910072 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1486  hypothetical protein  33.62 
 
 		 217 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>