11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2084 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2091  protein GP55  100 
 
 		 165 aa  321  2e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0071372  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2084  phage-tail assembly-like protein  100 
 
 		 160 aa  322  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1643  hypothetical protein  89.94 
 
 		 165 aa  288  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000036916  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0687  protein gp55  70 
 
 		 178 aa  204  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533043 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2082  hypothetical protein  67.92 
 
 		 177 aa  198  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1435  hypothetical protein  67.92 
 
 		 177 aa  198  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.708489  normal  0.312152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2094  hypothetical protein  31.45 
 
 		 171 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.217018  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1097  hypothetical protein  30.38 
 
 		 183 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926536 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4458  protein gp55  29.11 
 
 		 180 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000235907 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2766  hypothetical protein  31.39 
 
 		 175 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15269  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4036  hypothetical protein  32.03 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>