24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1247 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02332  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02294  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1247  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.785761 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1229  protein of unknown function DUF1131  98.95 
 
 		 191 aa  393  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2804  hypothetical protein  98.95 
 
 		 191 aa  393  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2718  hypothetical protein  98.43 
 
 		 191 aa  390  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2569  hypothetical protein  98.43 
 
 		 191 aa  391  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3662  hypothetical protein  97.91 
 
 		 191 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2587  hypothetical protein  97.91 
 
 		 191 aa  388  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2813  hypothetical protein  81.15 
 
 		 191 aa  303  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.749922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2641  hypothetical protein  81.15 
 
 		 191 aa  303  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2683  hypothetical protein  81.15 
 
 		 191 aa  303  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2707  hypothetical protein  80.63 
 
 		 191 aa  302  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2592  hypothetical protein  80.63 
 
 		 191 aa  302  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2953  hypothetical protein  70.62 
 
 		 194 aa  300  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.848863  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0763  hypothetical protein  54.05 
 
 		 203 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3459  hypothetical protein  56.25 
 
 		 194 aa  216  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1290  hypothetical protein  57.06 
 
 		 203 aa  209  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.281875  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1398  hypothetical protein  57.06 
 
 		 203 aa  209  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2779  hypothetical protein  57.06 
 
 		 203 aa  209  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116441 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1000  hypothetical protein  55.17 
 
 		 205 aa  208  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508776  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3205  hypothetical protein  50.86 
 
 		 194 aa  194  9e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3284  hypothetical protein  50.25 
 
 		 202 aa  184  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1984  hypothetical protein  26.85 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>