22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4834 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_3689  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  96.01 
 
 
326 aa  666    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4534  hypothetical protein  96.01 
 
 
326 aa  665    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0305375  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4908  hypothetical protein  97.24 
 
 
326 aa  672    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4834  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  689    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04138  hypothetical protein  96.01 
 
 
326 aa  666    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5813  hypothetical protein  95.71 
 
 
326 aa  665    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.358202 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04176  hypothetical protein  96.01 
 
 
326 aa  666    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1447  YjhS  57.23 
 
 
618 aa  378  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2790  hypothetical protein  55.66 
 
 
616 aa  378  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.578932  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2258  hypothetical protein  55.66 
 
 
616 aa  378  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000616827 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2188  hypothetical protein  55.03 
 
 
616 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.162911  hitchhiker  0.0000018311 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1168  hypothetical protein  54.72 
 
 
616 aa  371  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.44098 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3879  hypothetical protein  55.35 
 
 
617 aa  373  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2904  hypothetical protein  54.6 
 
 
645 aa  368  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.148641  hitchhiker  0.0000000129832 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3531  hypothetical protein  54.97 
 
 
645 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000115281 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1852  hypothetical protein  54.29 
 
 
648 aa  365  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0338393  hitchhiker  0.0000000502034 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3147  hypothetical protein  54.6 
 
 
648 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.05246  hitchhiker  0.000000000290208 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3214  hypothetical protein  54.29 
 
 
648 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0279968 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1266  YjhS  54.46 
 
 
621 aa  363  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0323184  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2192  YjhS  54.46 
 
 
462 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000609291  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1524  YjhS  49.43 
 
 
430 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2555  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  23.83 
 
 
264 aa  49.3  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880484  normal  0.133865 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>