12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4687 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4687  hypothetical protein  100 
 
 		 497 aa  1026    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0268272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4761  hypothetical protein  57.55 
 
 		 462 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4796  hypothetical protein  57.55 
 
 		 462 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4155  hypothetical protein  32.93 
 
 		 670 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4324  putative lipoprotein  34.56 
 
 		 492 aa  208  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4686  hypothetical protein  35.86 
 
 		 385 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4760  hypothetical protein  37.72 
 
 		 379 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4795  hypothetical protein  37.72 
 
 		 379 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4030  putative lipoprotein  33.6 
 
 		 489 aa  193  5e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4029  hypothetical protein  36.99 
 
 		 441 aa  189  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4323  hypothetical protein  36.68 
 
 		 437 aa  187  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4459  hypothetical protein  43.85 
 
 		 144 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000139078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>