12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4686 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4686  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  795    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4760  hypothetical protein  49.1 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4795  hypothetical protein  49.1 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4459  hypothetical protein  88.11 
 
 		 144 aa  268  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000139078  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4687  hypothetical protein  35.86 
 
 		 497 aa  197  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0268272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4761  hypothetical protein  33.24 
 
 		 462 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4796  hypothetical protein  33.51 
 
 		 462 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4029  hypothetical protein  32.43 
 
 		 441 aa  169  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4324  putative lipoprotein  33.43 
 
 		 492 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4155  hypothetical protein  32.17 
 
 		 670 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4323  hypothetical protein  32.67 
 
 		 437 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4030  putative lipoprotein  31.16 
 
 		 489 aa  143  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>