51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4653 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3811  phage shock protein A, PspA  99.57 
 
 		 232 aa  447  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04011  hypothetical protein  99.57 
 
 		 232 aa  447  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4653  PspA/IM30 family protein  100 
 
 		 232 aa  450  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.618876 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3831  phage shock protein A, PspA  99.57 
 
 		 232 aa  447  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000771014 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4742  PspA/IM30 family protein  99.57 
 
 		 232 aa  447  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.473518  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04049  predicted transcriptional regulator effector protein  99.57 
 
 		 232 aa  447  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5698  PspA/IM30 family protein  98.71 
 
 		 232 aa  443  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4426  PspA/IM30 family protein  99.14 
 
 		 232 aa  443  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4768  PspA/IM30 family protein  88.36 
 
 		 232 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4649  PspA/IM30 family protein  88.79 
 
 		 232 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4789  PspA/IM30 family protein  88.36 
 
 		 232 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4732  PspA/IM30 family protein  88.36 
 
 		 232 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1404  phage shock protein A, PspA  38.05 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.792709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3479  ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6  37.39 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.111551  normal  0.0139812 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3786  PspA/IM30 family protein  39.11 
 
 		 235 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1693  PspA/IM30  38.22 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.509577  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1224  phage shock protein A, PspA  34.51 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01340  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  35.84 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5044  phage shock protein A, PspA  34.8 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169336 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3389  phage shock protein A, PspA  36.4 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3822  phage shock protein A, PspA  35.81 
 
 		 236 aa  108  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.302506  normal  0.194258 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3838  phage shock protein A, PspA  33.48 
 
 		 228 aa  101  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.867887  unclonable  0.00000000015087 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0722  phage shock protein A, PspA  33.04 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000273053  hitchhiker  0.000000222893 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2668  PspA/IM30  34.76 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.638244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1388  hypothetical protein  36.84 
 
 		 231 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0883629  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0623  phage shock protein A, PspA  33.48 
 
 		 228 aa  96.3  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02185  PspA/IM30 family protein  34.63 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16150  hypothetical protein  35.96 
 
 		 231 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3091  phage shock protein A, PspA  31.28 
 
 		 229 aa  95.1  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0777554  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5368  hypothetical protein  33.05 
 
 		 253 aa  95.1  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.813565  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0827  phage shock protein A, PspA  34.06 
 
 		 229 aa  95.1  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0888  phage shock protein A, PspA  31.28 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0755885  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3114  phage shock protein A, PspA  31.72 
 
 		 229 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.139469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0858  phage shock protein A, PspA  31.72 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.69065  normal  0.706037 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5273  phage shock protein A, PspA  33.77 
 
 		 244 aa  92.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0710942  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3765  hypothetical protein  31.72 
 
 		 229 aa  92  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0912  phage shock protein A, PspA  30.84 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0749469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5545  phage shock protein A, PspA  33.77 
 
 		 244 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892809 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0697  PspA/IM30  30.74 
 
 		 229 aa  90.9  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000488945  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3450  phage shock protein A, PspA  30.84 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.613908  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0922  phage shock protein A, PspA  30.84 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0185  phage shock protein A, PspA  30.84 
 
 		 227 aa  90.9  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3482  phage shock protein A, PspA  30.3 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0916026  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3266  phage shock protein A, PspA  31.33 
 
 		 229 aa  89.4  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.942546  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3703  phage shock protein A, PspA  32.44 
 
 		 232 aa  86.3  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4191  PspA/IM30 family protein  29.13 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1637  phage shock protein A, PspA  29.96 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0735  phage shock protein A, PspA  30.4 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0677  phage shock protein A, PspA  30.4 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2993  phage shock protein A, PspA  26.75 
 
 		 225 aa  52  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.403474  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4580  phage shock protein A, PspA  27.16 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0606937  normal  0.0580714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>