31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4202 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4202  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  589  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910072 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03715  conserved hypothetical protein  98.6 
 
 		 286 aa  584  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03664  hypothetical protein  98.6 
 
 		 286 aa  584  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0581  hypothetical protein  32.65 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00278  hypothetical protein  26.39 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0383  hypothetical protein  26.74 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.370097 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00275  hypothetical protein  26.39 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2123  hypothetical protein  32.46 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0350  hypothetical protein  26.22 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3304  hypothetical protein  26.01 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0338  hypothetical protein  26.74 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0380  hypothetical protein  26.74 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3287  conserved hypothetical protein  26.01 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0786  hypothetical protein  30.7 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3107  hypothetical protein  36.04 
 
 		 336 aa  53.5  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.921908  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0558  hypothetical protein  31.82 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0684947  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3102  putative carboxylase  31.82 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0594  hypothetical protein  31.82 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153196  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0565  hypothetical protein  32.73 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.474357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0584  putative cytoplasmic protein  32.73 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0954621 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0639  hypothetical protein  32.73 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.31539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0579  hypothetical protein  32.73 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2233  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.143209 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0454  hypothetical protein  31.82 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0103919  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0621  hypothetical protein  32.73 
 
 		 271 aa  43.5  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.492624  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3093  putative carboxylase  32.73 
 
 		 271 aa  43.5  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00475  hypothetical protein  32.73 
 
 		 271 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2970  hypothetical protein  31.4 
 
 		 331 aa  43.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00184088  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6673  hypothetical protein  31.85 
 
 		 296 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148245  normal  0.182212 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00470  hypothetical protein  32.73 
 
 		 239 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0577  putative cytoplasmic protein  31.82 
 
 		 269 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.463481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>