56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0661 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2985  Rare lipoprotein B  100 
 
 		 193 aa  395  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576155  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0610  LPS-assembly lipoprotein RlpB  100 
 
 		 193 aa  395  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00711824  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0661  LPS-assembly lipoprotein RlpB  100 
 
 		 193 aa  395  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0110358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0693  LPS-assembly lipoprotein RlpB  100 
 
 		 193 aa  395  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00387404  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0667  LPS-assembly lipoprotein RlpB  100 
 
 		 193 aa  395  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000932859  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00599  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.025084  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00610  minor lipoprotein  100 
 
 		 193 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0274387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3004  LPS-assembly lipoprotein RlpB  95.85 
 
 		 193 aa  358  2e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00131027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0730  LPS-assembly lipoprotein RlpB  95.34 
 
 		 193 aa  357  8e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0031107  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0750  LPS-assembly lipoprotein RlpB  79.08 
 
 		 196 aa  325  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0704  LPS-assembly lipoprotein RlpB  79.08 
 
 		 196 aa  325  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.712434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0763  LPS-assembly lipoprotein RlpB  79.08 
 
 		 196 aa  325  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.447901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0807  LPS-assembly lipoprotein RlpB  79.08 
 
 		 196 aa  325  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.914545 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0690  LPS-assembly lipoprotein RlpB  79.59 
 
 		 196 aa  325  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0364606  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1175  LPS-assembly lipoprotein RlpB  67.8 
 
 		 189 aa  259  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1186  LPS-assembly lipoprotein RlpB  55.87 
 
 		 184 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3145  LPS-assembly lipoprotein RlpB  56.67 
 
 		 184 aa  211  7e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1206  LPS-assembly lipoprotein RlpB  62 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.730747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2959  LPS-assembly lipoprotein RlpB  54.72 
 
 		 184 aa  190  9e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1097  LPS-assembly lipoprotein RlpB  56 
 
 		 182 aa  190  9e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.590366  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1843  LPS-assembly lipoprotein RlpB  46.7 
 
 		 207 aa  176  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2927  LPS-assembly lipoprotein RlpB  46.7 
 
 		 207 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3016  LPS-assembly lipoprotein RlpB  46.7 
 
 		 207 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.446987  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2583  rare lipoprotein B  36.81 
 
 		 164 aa  117  9e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.446935 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2864  rare lipoprotein B  35.19 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012268  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1000  rare lipoprotein B  35.4 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115178  normal  0.163142 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1061  rare lipoprotein B  35.4 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.702288  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0996  rare lipoprotein B  35.4 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.106946  normal  0.100935 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1556  rare lipoprotein B  36.54 
 
 		 167 aa  116  3e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.22375  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1173  rare lipoprotein B  35.4 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1097  Rare lipoprotein B  34.42 
 
 		 164 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0312036  hitchhiker  0.000000000546863 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3448  rare lipoprotein B  34.42 
 
 		 164 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.124406  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3270  rare lipoprotein B  34.42 
 
 		 164 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.527962  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0989  rare lipoprotein B precursor  33.67 
 
 		 210 aa  110  9e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004218  LPS-assembly lipoprotein RlpB precursor  39.29 
 
 		 179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00101724  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3312  rare lipoprotein B  33.77 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000159395  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2930  rare lipoprotein B  34.57 
 
 		 164 aa  108  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.692064  decreased coverage  0.00636409 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0704  rare lipoprotein B  35.67 
 
 		 169 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00180129  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01221  hypothetical protein  36.9 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3144  rare lipoprotein B  33.99 
 
 		 164 aa  105  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000366189  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3703  rare lipoprotein B  33.55 
 
 		 164 aa  104  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00988017  hitchhiker  0.0000022488 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3480  rare lipoprotein B  31.48 
 
 		 164 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0408224  hitchhiker  0.000000129712 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0796  rare lipoprotein B  33.76 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.256578  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0477  rare lipoprotein B  36.42 
 
 		 213 aa  98.6  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.421577  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1721  rare lipoprotein B  32.21 
 
 		 167 aa  92.4  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1190  rare lipoprotein B  28.12 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1565  rare lipoprotein B  29.38 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1300  hypothetical protein  26.88 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1301  hypothetical protein  26.88 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2916  rare lipoprotein B precursor  30.48 
 
 		 171 aa  52.4  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3309  hypothetical protein  25.61 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0269686 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2444  putative lipoprotein B precursor transmembrane  29.03 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.553692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1452  rare lipoprotein B  26.25 
 
 		 172 aa  48.5  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.334843  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0512  rare lipoprotein B  26.97 
 
 		 170 aa  45.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2745  rare lipoprotein B  26.71 
 
 		 191 aa  45.4  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2911  Rare lipoprotein B  24 
 
 		 194 aa  42  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398156  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>