28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0350 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0350  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  600  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3287  conserved hypothetical protein  96.86 
 
 		 287 aa  583  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3304  hypothetical protein  96.86 
 
 		 287 aa  583  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0383  hypothetical protein  96.86 
 
 		 287 aa  580  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.370097 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0380  hypothetical protein  95.47 
 
 		 287 aa  578  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0338  hypothetical protein  95.47 
 
 		 287 aa  578  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00278  hypothetical protein  94.77 
 
 		 287 aa  574  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00275  hypothetical protein  94.77 
 
 		 287 aa  574  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03715  conserved hypothetical protein  26.89 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03664  hypothetical protein  26.89 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4202  hypothetical protein  26.22 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910072 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0577  putative cytoplasmic protein  26.05 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.463481  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0639  hypothetical protein  26.05 
 
 		 262 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.31539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0579  hypothetical protein  26.05 
 
 		 262 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0584  putative cytoplasmic protein  26.05 
 
 		 269 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0954621 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2233  hypothetical protein  27.87 
 
 		 308 aa  52.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.143209 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2970  hypothetical protein  23.32 
 
 		 331 aa  49.7  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00184088  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0565  hypothetical protein  24.72 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.474357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0558  hypothetical protein  25.94 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0684947  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3102  putative carboxylase  25.95 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0594  hypothetical protein  25.95 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153196  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3107  hypothetical protein  32.38 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.921908  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0454  hypothetical protein  25.55 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0103919  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00475  hypothetical protein  25.55 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0621  hypothetical protein  24.72 
 
 		 271 aa  47  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.492624  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3093  putative carboxylase  24.72 
 
 		 271 aa  47  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00470  hypothetical protein  26.19 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0581  hypothetical protein  32.76 
 
 		 288 aa  43.5  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>