11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0147 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0147  putative fimbrial protein  100 
 
 		 198 aa  403  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3466  putative fimbrial protein  68.18 
 
 		 198 aa  286  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00135  predicted fimbrial-like adhesin protein  65.66 
 
 		 198 aa  283  8e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.414874  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0140  hypothetical protein  65.66 
 
 		 198 aa  283  8e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0281116  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0139  hypothetical protein  65.66 
 
 		 198 aa  283  8e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00134  hypothetical protein  65 
 
 		 120 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.371088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3523  fimbrial protein  42.63 
 
 		 196 aa  151  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.244973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0145  fimbrial protein  42.33 
 
 		 196 aa  141  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.751304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3971  fimbrial protein  40.78 
 
 		 197 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0204  hypothetical protein  38.54 
 
 		 187 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0646663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0206  putative fimbrial protein  36.16 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.753948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>