12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A4459 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A4459  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  301  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000139078  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4686  hypothetical protein  88.11 
 
 
385 aa  268  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147095  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4760  hypothetical protein  49.3 
 
 
379 aa  140  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4795  hypothetical protein  49.3 
 
 
379 aa  140  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4029  hypothetical protein  40.98 
 
 
441 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4687  hypothetical protein  43.85 
 
 
497 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0268272  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4761  hypothetical protein  42.07 
 
 
462 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4796  hypothetical protein  42.07 
 
 
462 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4155  hypothetical protein  38.57 
 
 
670 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4324  putative lipoprotein  39.68 
 
 
492 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4323  hypothetical protein  63.64 
 
 
437 aa  84  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4030  putative lipoprotein  38.1 
 
 
489 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>