13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A4030 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A4030  putative lipoprotein  100 
 
 
489 aa  1012    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4324  putative lipoprotein  87.8 
 
 
492 aa  866    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4155  hypothetical protein  63.03 
 
 
670 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4761  hypothetical protein  32.15 
 
 
462 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4796  hypothetical protein  31.68 
 
 
462 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4687  hypothetical protein  32.99 
 
 
497 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0268272  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4029  hypothetical protein  33.51 
 
 
441 aa  195  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4323  hypothetical protein  36.31 
 
 
437 aa  194  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4760  hypothetical protein  33.13 
 
 
379 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4795  hypothetical protein  33.13 
 
 
379 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4686  hypothetical protein  29.89 
 
 
385 aa  144  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147095  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4173  putative lipoprotein  96.15 
 
 
87 aa  83.6  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0249702 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4459  hypothetical protein  33.76 
 
 
144 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000139078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>