13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A4029 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A4029  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  910    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4323  hypothetical protein  95.01 
 
 		 437 aa  860    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4155  hypothetical protein  37.26 
 
 		 670 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4324  putative lipoprotein  35.09 
 
 		 492 aa  197  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4030  putative lipoprotein  33.51 
 
 		 489 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4761  hypothetical protein  33.94 
 
 		 462 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4796  hypothetical protein  33.94 
 
 		 462 aa  190  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4687  hypothetical protein  36.99 
 
 		 497 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0268272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4760  hypothetical protein  33.82 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4795  hypothetical protein  33.82 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4686  hypothetical protein  32.43 
 
 		 385 aa  169  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4459  hypothetical protein  40.98 
 
 		 144 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000139078  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4173  putative lipoprotein  87.5 
 
 		 87 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0249702 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>