16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2088 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2088  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  259  8e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3117  DNA circulation family protein  45.53 
 
 		 468 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2815  DNA circulation family protein  42.28 
 
 		 468 aa  104  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1469  putative DNA circulation protein  42.28 
 
 		 468 aa  103  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.539442 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2737  putative DNA circulation protein  42.28 
 
 		 468 aa  103  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3051  putative bacteriophage DNA circulation protein, Mu-like  39.66 
 
 		 475 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.273853  hitchhiker  0.000025391 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1874  DNA circulation family protein  36.04 
 
 		 490 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000818097 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4591  DNA circulation, N-terminal  32.97 
 
 		 470 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1158  DNA circulation-like  30.91 
 
 		 411 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3864  phage FluMu DNA circulation protein, putative  34.29 
 
 		 420 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3737  DNA circulation-like  32.63 
 
 		 415 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6587  putative Mu-like prophage DNA circulation protein  27.62 
 
 		 422 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2588  DNA circulation family protein  32.05 
 
 		 438 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0328137 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2252  tail/DNA circulation protein  48.48 
 
 		 446 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.257831 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4477  tail/DNA circulation protein  48.48 
 
 		 446 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305287 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2255  tail/DNA circulation protein  48.48 
 
 		 446 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000334711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>