57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0943 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0943  phage major tail tube protein  100 
 
 
171 aa  347  3e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2492  phage major tail tube protein FII  100 
 
 
171 aa  347  3e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.821956  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2755  phage major tail tube protein  98.83 
 
 
171 aa  345  2e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000395908 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2847  phage major tail tube protein FII  95.32 
 
 
171 aa  335  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3030  phage major tail tube protein FII  94.74 
 
 
171 aa  333  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00222332 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2894  phage major tail tube protein  62.57 
 
 
171 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2188  tail tube protein  60.23 
 
 
171 aa  222  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2301  phage major tail tube protein  60.23 
 
 
171 aa  222  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2348  phage major tail tube protein  60.23 
 
 
171 aa  222  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0862  phage major tail tube protein  61.99 
 
 
169 aa  220  9e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.189213  hitchhiker  0.00295968 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4384  phage major tail tube protein  58.14 
 
 
172 aa  207  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  hitchhiker  0.00216256 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3481  phage major tail tube protein  58.72 
 
 
172 aa  206  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0860843 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3193  phage major tail tube protein  54.65 
 
 
173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37390  Phage P2 FII-like protein  51.46 
 
 
171 aa  195  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2100  phage major tail tube protein  54.65 
 
 
172 aa  190  8e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1814  phage major tail tube protein  54.65 
 
 
172 aa  188  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00232841  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4346  phage major tail tube protein FII  52.91 
 
 
172 aa  184  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.130491 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3029  phage major tail tube protein FII  52.91 
 
 
172 aa  184  6e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836239 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01343  phage major tail tube protein  51.76 
 
 
169 aa  178  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.822943  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2663  phage major tail tube protein  50.29 
 
 
171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1378  phage major tail tube protein  48.54 
 
 
170 aa  165  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.304056  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1917  phage major tail tube-like protein  49.12 
 
 
169 aa  164  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4857  phage major tail tube protein  49.12 
 
 
169 aa  163  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.662174  normal  0.797605 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0184  phage major tail tube protein  48.54 
 
 
169 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3309  phage major tail tube protein  47.95 
 
 
170 aa  156  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.241259  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2674  phage major tail tube protein  48.26 
 
 
170 aa  148  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0110743 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1330  phage major tail tube protein  43.86 
 
 
169 aa  147  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2591  phage major tail tube protein  42.69 
 
 
169 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.213211  hitchhiker  0.0000000491617 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2625  phage major tail tube protein  42.69 
 
 
169 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169014  hitchhiker  0.000000417422 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4039  phage major tail tube protein  39.05 
 
 
169 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000617415 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3395  major tail tube protein  39.64 
 
 
169 aa  117  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0766  phage major tail tube protein  41.42 
 
 
167 aa  117  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0748  Phage major tail tube protein  39.77 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.17679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08090  putative phage tail tube protein  39.64 
 
 
167 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  8.01522e-16  hitchhiker  0.000177161 
 
 
-
 
NC_002978  WD0574  contractile tail tube protein  36.69 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3060  pyocin R2_PP, tail tube protein  37.87 
 
 
169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.167216 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1213  phage major tail tube protein  37.28 
 
 
169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0024184 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1157  phage major tail tube protein  38.42 
 
 
169 aa  107  5e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0396  hypothetical protein  36.05 
 
 
169 aa  106  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1135  hypothetical protein  36.05 
 
 
169 aa  106  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1859  phage major tail tube protein  31.98 
 
 
167 aa  93.6  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1283  phage major tail tube protein  34.5 
 
 
168 aa  93.6  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.299866 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0886  phage major tail tube protein  35.84 
 
 
167 aa  90.5  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6178  putative phage tail tube protein FII  29.48 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.672659  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1629  contractile tail tube protein  29.56 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3325  phage major tail tube protein  28.08 
 
 
171 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489725  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2377  phage major tail tube protein  27.4 
 
 
171 aa  58.2  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2294  phage major tail tube protein  26.79 
 
 
168 aa  57  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4913  major tail tube protein  25.57 
 
 
173 aa  56.6  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.79604 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1213  phage major tail tube protein  25.71 
 
 
175 aa  54.3  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.443458  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4129  major tail tube protein  24 
 
 
175 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1566  phage major tail tube protein  22.62 
 
 
174 aa  48.1  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2896  phage major tail tube protein  22.62 
 
 
174 aa  48.1  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2918  prophage MuMc02, major tail tube protein  23.53 
 
 
173 aa  48.1  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4468  phage major tail tube protein  23.39 
 
 
174 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4553  phage major tail tube protein  23.39 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00640021  normal  0.47979 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4552  phage major tail tube protein  22.81 
 
 
174 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.845098  normal  0.36933 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>