11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0140 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00135  predicted fimbrial-like adhesin protein  100 
 
 		 198 aa  408  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.414874  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0140  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  408  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0281116  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0139  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  408  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3466  putative fimbrial protein  83.33 
 
 		 198 aa  348  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0147  putative fimbrial protein  65.66 
 
 		 198 aa  283  8e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00134  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  250  8.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.371088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3523  fimbrial protein  42.63 
 
 		 196 aa  148  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.244973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0145  fimbrial protein  43.52 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.751304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3971  fimbrial protein  38.89 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0204  hypothetical protein  37.29 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0646663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0206  putative fimbrial protein  38.86 
 
 		 199 aa  95.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.753948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>