23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0127 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_3480  conserved hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00125403  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00120  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0106649  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0129  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00178976  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0115  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000937496  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0132  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.120406  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3537  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00221389  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00121  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0136947  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0124  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.621631  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0127  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000275636  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0670  hypothetical protein  96.52 
 
 
153 aa  235  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000435757  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0191  hypothetical protein  95.65 
 
 
128 aa  230  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0183  hypothetical protein  95.65 
 
 
115 aa  229  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0186  hypothetical protein  95.65 
 
 
115 aa  229  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.448857 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0182  hypothetical protein  94.78 
 
 
115 aa  227  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0199  hypothetical protein  95.37 
 
 
108 aa  215  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1022  hypothetical protein  71.7 
 
 
108 aa  164  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3353  hypothetical protein  77.89 
 
 
115 aa  163  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000420565  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3481  hypothetical protein  77.89 
 
 
115 aa  163  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.264996  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4000  hypothetical protein  76.84 
 
 
116 aa  163  9e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1017  hypothetical protein  75.27 
 
 
115 aa  149  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2835  hypothetical protein  64.29 
 
 
115 aa  149  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3128  hypothetical protein  71.28 
 
 
115 aa  148  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1150  hypothetical protein  70.21 
 
 
115 aa  148  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>