14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4324 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A4030  putative lipoprotein  87.8 
 
 
489 aa  866    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4324  putative lipoprotein  100 
 
 
492 aa  1016    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4155  hypothetical protein  63.64 
 
 
670 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4761  hypothetical protein  33.48 
 
 
462 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4687  hypothetical protein  34.61 
 
 
497 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0268272  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4796  hypothetical protein  33.04 
 
 
462 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4323  hypothetical protein  35.38 
 
 
437 aa  197  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4029  hypothetical protein  35.09 
 
 
441 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4760  hypothetical protein  34.94 
 
 
379 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4795  hypothetical protein  34.94 
 
 
379 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4686  hypothetical protein  31.98 
 
 
385 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147095  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4459  hypothetical protein  35.03 
 
 
144 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000139078  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4173  putative lipoprotein  92.31 
 
 
87 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0249702 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2524  hypothetical protein  26.51 
 
 
298 aa  43.9  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000801277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>