19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2055 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_1806  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  159  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235926  normal  0.209126 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01785  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.207799  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1361  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  159  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000301394  normal  0.0153989 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01797  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.123593  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2055  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  159  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000329563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1917  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  159  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128358  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1817  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  159  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103647  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2558  hypothetical protein  98.73 
 
 		 79 aa  156  8e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000983245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2094  hypothetical protein  97.47 
 
 		 79 aa  156  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195578  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2396  hypothetical protein  74.68 
 
 		 79 aa  132  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0391359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1984  hypothetical protein  74.68 
 
 		 79 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00421137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1980  hypothetical protein  73.42 
 
 		 79 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.308421  normal  0.11648 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2042  hypothetical protein  73.42 
 
 		 79 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.167774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1290  hypothetical protein  73.42 
 
 		 79 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000505216  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1474  hypothetical protein  73.42 
 
 		 79 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000674727  normal  0.446857 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2481  hypothetical protein  55.88 
 
 		 77 aa  88.2  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.764114  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2385  hypothetical protein  55.88 
 
 		 77 aa  88.2  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000054644  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1669  hypothetical protein  58.73 
 
 		 72 aa  86.3  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00399025  normal  0.292438 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2830  hypothetical protein  50.65 
 
 		 77 aa  85.5  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163474  hitchhiker  0.00306299 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>