23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1045 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1045  phage protein GP46  100 
 
 
145 aa  290  5e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3048  putative bacteriophage protein GP46, Mu-like  45.52 
 
 
149 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000162081 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3734  phage GP46  51.54 
 
 
155 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1871  GP46 family protein  42.52 
 
 
405 aa  93.6  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.881976  hitchhiker  0.000000000000640584 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2701  hypothetical protein  42.31 
 
 
151 aa  88.6  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0695  phage protein GP46  47.27 
 
 
149 aa  87.8  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0742  phage protein GP46  47.27 
 
 
149 aa  87.8  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3114  GP46 family protein  43.88 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2812  GP46 family protein  43.85 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1472  phage protein GP46  43.85 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2085  phage protein GP46  44.72 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2734  phage protein GP46  43.85 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.86914  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3861  phage FluMu protein gp46  44.14 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4588  Phage GP46  45.61 
 
 
132 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1161  Phage FluMu protein gp46  50 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2252  phage protein GP46  36.76 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00086337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4480  phage protein GP46  36.76 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228565 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2585  phage GP46 family protein  41.07 
 
 
141 aa  62  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.135716 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2249  phage protein GP46  36.76 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.213906 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4483  GP46 family protein  33.82 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.185083 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0186  hypothetical protein  44.29 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6584  putative bacteriophage protein, GP46-like protein  36.07 
 
 
185 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2445  hypothetical protein  27.5 
 
 
190 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>