21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1273 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1273  putative outer membrane protein  100 
 
 
394 aa  807    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2107  hypothetical protein  35.38 
 
 
425 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0010339  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2166  hypothetical protein  35.38 
 
 
425 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0114121  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2275  hypothetical protein  35.38 
 
 
449 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0256688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0500  hypothetical protein  34.17 
 
 
455 aa  159  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.5659  decreased coverage  0.000668779 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4045  hypothetical protein  34.17 
 
 
455 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.246264  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0168  hypothetical protein  34.17 
 
 
425 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37010  fimbrial subunit CupA4  30.81 
 
 
453 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3020  fimbrial subunit  30.15 
 
 
448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59750  fimbrial subunit  29.93 
 
 
448 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000000000000441836  hitchhiker  2.5403100000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2830  hypothetical protein  29.95 
 
 
474 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1664  hypothetical protein  28.78 
 
 
475 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.393948  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0377  putative fimbrial usher  27.54 
 
 
441 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.898506  normal  0.223329 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0430  putative fimbrial usher  27.54 
 
 
441 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.278902  hitchhiker  0.000289263 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0390  putative fimbrial usher  27.54 
 
 
441 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.097978 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0368  putative fimbrial usher  27.54 
 
 
441 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.584072 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0370  putative fimbrial usher  27.3 
 
 
441 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0295  hypothetical protein  32.22 
 
 
457 aa  79  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0301  fimbrial subunit  25.71 
 
 
456 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2008  putative fimbriae; usher  33.73 
 
 
174 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.446551  normal  0.112656 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0297  fimbrial subunit  25.61 
 
 
447 aa  52.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>