28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00418 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3143  Primosomal replication priB and priC  100 
 
 		 175 aa  341  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00423  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  341  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0862408  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00418  primosomal replication protein N''  100 
 
 		 175 aa  341  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0764995  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0503  primosomal replication protein N''  100 
 
 		 175 aa  341  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.151762  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0399  primosomal replication protein N''  99.43 
 
 		 175 aa  340  8e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.436694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3149  primosomal replication protein N''  99.43 
 
 		 175 aa  340  8e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119522  normal  0.373691 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0544  primosomal replication protein N''  99.43 
 
 		 175 aa  340  8e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0510  primosomal replication protein N''  97.71 
 
 		 175 aa  337  7e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00536071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0557  primosomal replication protein N''  97.71 
 
 		 175 aa  335  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0959641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0541  primosomal replication protein N''  73.71 
 
 		 175 aa  254  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0525  primosomal replication protein N''  73.71 
 
 		 175 aa  254  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0522  primosomal replication protein N''  73.1 
 
 		 171 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0585  primosomal replication protein N''  73.1 
 
 		 171 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0531  primosomal replication protein N''  72.51 
 
 		 171 aa  245  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0947  primosomal replication protein N''  55.43 
 
 		 175 aa  179  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.815884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3062  primosomal replication protein n''  38.1 
 
 		 178 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3202  primosomal replication priB and priC  38.1 
 
 		 178 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2885  primosomal replication protein n''  38.1 
 
 		 178 aa  108  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0303464 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1073  Primosomal replication priB and priC  39.31 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0102132  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1015  Primosomal replication priB and priC  41.28 
 
 		 178 aa  104  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.265941  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3238  Primosomal replication priB and priC  38.15 
 
 		 178 aa  104  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104789  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3043  Primosomal replication priB and priC  40.12 
 
 		 177 aa  103  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1132  primosomal replication priB and priC  39.66 
 
 		 178 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1127  primosomal replication protein N''  30.34 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1448  primosomal replication protein N``  33.33 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000618679  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003965  primosomal replication protein N''  34.01 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0128436  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01555  primosomal replication protein N''  32.88 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3758  putative primosomal replication protein N''  42.59 
 
 		 227 aa  41.2  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>