87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1362 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1362  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  348  1e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0502  hypothetical protein  59.26 
 
 		 210 aa  209  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000282211 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2062  hypothetical protein  58.08 
 
 		 173 aa  205  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  31.14 
 
 		 187 aa  100  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2465  hypothetical protein  35.44 
 
 		 169 aa  95.1  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000697447  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1583  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3779  hypothetical protein  36.51 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1133  hypothetical protein  36.73 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2870  hypothetical protein  30.06 
 
 		 208 aa  77.4  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163842 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27551  hypothetical protein  30.82 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2630  hypothetical protein  32.53 
 
 		 191 aa  74.3  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662517  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  30.47 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1557  hypothetical protein  29.31 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3130  hypothetical protein  31.08 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4133  hypothetical protein  29.58 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000340149  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02661  hypothetical protein  29.31 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2137  hypothetical protein  29.08 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1399  hypothetical protein  26.97 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0192  hypothetical protein  31.65 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02081  hypothetical protein  31.43 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.235056  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3780  uncharacterized protein-like protein  28.57 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0161725  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2454  hypothetical protein  29.63 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0390  hypothetical protein  28.28 
 
 		 160 aa  62  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.371828  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  31.3 
 
 		 175 aa  62  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  29.5 
 
 		 175 aa  62  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3864  uncharacterized protein-like protein  27.21 
 
 		 160 aa  62  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  30.08 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  30.08 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0470  hypothetical protein  28.4 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0466774  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02101  hypothetical protein  30.71 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0337781  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  29.71 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  29.93 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0515  hypothetical protein  25.57 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  32.14 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02191  hypothetical protein  32.35 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0658  hypothetical protein  31.06 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0651  hypothetical protein  31.06 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.849018  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  32.9 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  35.04 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02081  hypothetical protein  35.77 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.817359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0526  hypothetical protein  30.12 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.983156  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2575  hypothetical protein  29.14 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0291416 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0195  hypothetical protein  32.2 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2731  hypothetical protein  31.45 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  24.17 
 
 		 181 aa  52.4  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  28.46 
 
 		 174 aa  52  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  28.99 
 
 		 212 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0898  hypothetical protein  27.2 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  41.56 
 
 		 188 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  43.08 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1386  hypothetical protein  22.6 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0995  hypothetical protein  30.97 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0304  hypothetical protein  21.59 
 
 		 218 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.785913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1671  hypothetical protein  21.59 
 
 		 218 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1148  hypothetical protein  28.4 
 
 		 196 aa  48.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5943  hypothetical protein  28.38 
 
 		 177 aa  48.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0572526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0947  hypothetical protein  28.48 
 
 		 177 aa  48.1  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2626  hypothetical protein  32.58 
 
 		 198 aa  47  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4035  hypothetical protein  26.11 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4151  hypothetical protein  26.11 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4350  hypothetical protein  26.11 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.632736  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3868  hypothetical protein  26.11 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00576975  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2123  hypothetical protein  31.33 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  25.2 
 
 		 185 aa  44.7  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1636  hypothetical protein  39.71 
 
 		 168 aa  44.3  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.687372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01852  flagellar biosynthesis protein FlhF  26.25 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  21.88 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003989  hypothetical protein  28.07 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3882  group-specific protein  26.11 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4237  hypothetical protein  27.5 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2564  hypothetical protein  31.51 
 
 		 234 aa  42.4  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.164456  hitchhiker  0.00170184 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01533  hypothetical protein  28.07 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4261  hypothetical protein  25.41 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3957  hypothetical protein  27.39 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  31.03 
 
 		 179 aa  41.6  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1703  hypothetical protein  37.8 
 
 		 169 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2676  hypothetical protein  37.8 
 
 		 169 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1681  hypothetical protein  37.8 
 
 		 169 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4198  hypothetical protein  28.03 
 
 		 186 aa  42  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1666  hypothetical protein  37.8 
 
 		 169 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.257609  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2586  hypothetical protein  39.44 
 
 		 169 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.757893  normal  0.0816334 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2390  hypothetical protein  39.74 
 
 		 169 aa  41.2  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.194438  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0658  Protein of unknown function DUF2062  38.71 
 
 		 179 aa  41.2  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0999  hypothetical protein  26.88 
 
 		 185 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1335  hypothetical protein  31.2 
 
 		 169 aa  41.2  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1855  hypothetical protein  25.29 
 
 		 210 aa  41.2  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2804  hypothetical protein  37.8 
 
 		 169 aa  40.8  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>