23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1180 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1180  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  301  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.944923 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0282  hypothetical protein  58.06 
 
 
156 aa  166  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1184  hypothetical protein  50 
 
 
156 aa  155  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1236  hypothetical protein  53.55 
 
 
156 aa  154  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00104806  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0593  hypothetical protein  59.24 
 
 
158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0027  hypothetical protein  50.97 
 
 
156 aa  144  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2830  HAD family hydrolase  46.15 
 
 
156 aa  140  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1711  hypothetical protein  50 
 
 
155 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000195986  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0424  hypothetical protein  55.62 
 
 
160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1112  hypothetical protein  50.64 
 
 
156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00144751  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0830  soluble P-type ATPase  45.51 
 
 
156 aa  136  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2299  hypothetical protein  45.16 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0021594  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1047  hypothetical protein  52.9 
 
 
156 aa  130  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25270  soluble P-type ATPase  44.81 
 
 
154 aa  126  9.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0968329 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1135  hypothetical protein  45.16 
 
 
155 aa  117  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0477  HAD family hydrolase  32.47 
 
 
149 aa  97.8  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0341937  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0725  HAD family hydrolase  30.52 
 
 
149 aa  90.9  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1442  HAD family hydrolase  33.09 
 
 
131 aa  90.5  7e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0360  hypothetical protein  36.64 
 
 
127 aa  88.2  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.171021  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0545  HAD family hydrolase  34.45 
 
 
114 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0908352  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0280  Cof-like hydrolase  30.11 
 
 
264 aa  44.7  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  30.11 
 
 
268 aa  44.7  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3772  Cof-like hydrolase  37.14 
 
 
267 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.865494 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>