49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1133 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1133  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  457  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0502  hypothetical protein  40 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000282211 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2062  hypothetical protein  38.46 
 
 		 173 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1362  hypothetical protein  36.73 
 
 		 171 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0470  hypothetical protein  30.87 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0466774  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  30.6 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2870  hypothetical protein  32.82 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163842 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  32.17 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2575  hypothetical protein  30.98 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0291416 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1583  hypothetical protein  30.56 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2465  hypothetical protein  28.49 
 
 		 169 aa  64.7  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000697447  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3779  hypothetical protein  32.86 
 
 		 159 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2564  hypothetical protein  32.28 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.164456  hitchhiker  0.00170184 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  33.08 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0304  hypothetical protein  27.81 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.785913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1671  hypothetical protein  27.81 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1399  hypothetical protein  29.27 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  34.48 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0515  hypothetical protein  30.43 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1557  hypothetical protein  27.91 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0195  hypothetical protein  33.02 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1989  hypothetical protein  39.69 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5943  hypothetical protein  33.11 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0572526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27551  hypothetical protein  27.56 
 
 		 167 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2454  hypothetical protein  31.62 
 
 		 146 aa  55.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1855  hypothetical protein  27.75 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  31.88 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  35.14 
 
 		 186 aa  53.1  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02661  hypothetical protein  28 
 
 		 151 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  28.99 
 
 		 175 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2137  hypothetical protein  32.62 
 
 		 162 aa  50.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  26.61 
 
 		 174 aa  49.3  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2630  hypothetical protein  25.57 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662517  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  30.09 
 
 		 172 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4350  hypothetical protein  25.81 
 
 		 186 aa  45.4  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.632736  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4035  hypothetical protein  25.81 
 
 		 186 aa  45.4  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  27.56 
 
 		 175 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4151  hypothetical protein  25.81 
 
 		 185 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3868  hypothetical protein  24.46 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00576975  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  27.78 
 
 		 177 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  29.66 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  26.98 
 
 		 177 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0947  hypothetical protein  28.26 
 
 		 177 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  28.21 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  25.36 
 
 		 179 aa  43.5  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  27.56 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2833  hypothetical protein  38.81 
 
 		 182 aa  43.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0982426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  37 
 
 		 180 aa  42  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2731  hypothetical protein  31.34 
 
 		 176 aa  42  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>