15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3218 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3218  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  266  7e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.648594  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2651  hypothetical protein  87.5 
 
 
138 aa  222  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3226  hypothetical protein  79.37 
 
 
127 aa  207  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000034976 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0841  hypothetical protein  66.12 
 
 
135 aa  161  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03910  hypothetical protein  65.57 
 
 
146 aa  159  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2070  hypothetical protein  46.34 
 
 
125 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2838  hypothetical protein  41.94 
 
 
132 aa  97.1  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.584129 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1307  hypothetical protein  41.94 
 
 
132 aa  96.3  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.478307  normal  0.112678 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2067  hypothetical protein  41.94 
 
 
132 aa  96.3  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0169668  normal  0.0314213 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0817  hypothetical protein  42.37 
 
 
142 aa  94.4  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.595251  hitchhiker  0.0010958 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2763  hypothetical protein  37.1 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0729346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1242  hypothetical protein  37.1 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.451086  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2598  hypothetical protein  37.1 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0236117  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2912  hypothetical protein  37.1 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.887727  normal  0.370558 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3625  hypothetical protein  26.4 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>