43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2904 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1022  hypothetical protein  62.69 
 
 		 925 aa  997    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.52068  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2904  hypothetical protein  100 
 
 		 924 aa  1785    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.365436 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0685  double-transmembrane region-like  59.16 
 
 		 919 aa  1000    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.621898  normal  0.74897 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0205  hypothetical protein  62.68 
 
 		 921 aa  1023    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.556354 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2769  double-transmembrane region-like  59.76 
 
 		 929 aa  983    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.676495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2683  hypothetical protein  62.69 
 
 		 925 aa  996    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.574694 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2232  hypothetical protein  42.53 
 
 		 939 aa  573  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.610589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2794  hypothetical protein  39.73 
 
 		 937 aa  568  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.749604  normal  0.246775 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3058  hypothetical protein  39.18 
 
 		 937 aa  566  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0693886 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3232  hypothetical protein  39.14 
 
 		 942 aa  555  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.708508  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1558  hypothetical protein  39.54 
 
 		 949 aa  550  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1506  hypothetical protein  39.4 
 
 		 948 aa  550  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.446295  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2842  hypothetical protein  40.49 
 
 		 939 aa  546  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1607  hypothetical protein  38.91 
 
 		 957 aa  543  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557026  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2277  hypothetical protein  39.41 
 
 		 937 aa  535  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30304  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0723  hypothetical protein  40.13 
 
 		 914 aa  523  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1734  hypothetical protein  41.26 
 
 		 945 aa  523  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.093784 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1293  double-transmembrane region-like  38.24 
 
 		 941 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.397525 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2181  hypothetical protein  39.1 
 
 		 942 aa  509  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647375  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1457  hypothetical protein  40.84 
 
 		 945 aa  503  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.109883 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5169  hypothetical protein  42.46 
 
 		 939 aa  502  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.165999  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3253  double-transmembrane region-like  39.26 
 
 		 938 aa  498  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.331442  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1374  hypothetical protein  38.37 
 
 		 941 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.347989  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1454  hypothetical protein  40.95 
 
 		 943 aa  491  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.332859  normal  0.622098 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0914  double-transmembrane region-like  38.36 
 
 		 958 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3637  hypothetical protein  40.66 
 
 		 939 aa  487  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.504486  normal  0.363104 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1190  double-transmembrane region-like  37.79 
 
 		 941 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.546813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4482  hypothetical protein  41.46 
 
 		 941 aa  477  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.792341  hitchhiker  0.00755842 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0371  double-transmembrane region-like  39.56 
 
 		 927 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.601757  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3903  hypothetical protein  47.45 
 
 		 639 aa  446  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.436608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1009  hypothetical protein  32.84 
 
 		 932 aa  443  1e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.479574  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3011  hypothetical protein  38.19 
 
 		 940 aa  436  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0470546  normal  0.329062 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2005  hypothetical protein  34.46 
 
 		 892 aa  333  1e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3904  hypothetical protein  63.56 
 
 		 279 aa  308  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0103239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2269  hypothetical protein  36.96 
 
 		 940 aa  301  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.501234 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2946  hypothetical protein  37.88 
 
 		 943 aa  288  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.575307  normal  0.59944 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2628  double-transmembrane region  36.59 
 
 		 937 aa  273  1e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2547  hypothetical protein  36.14 
 
 		 255 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2644  hypothetical protein  35.8 
 
 		 256 aa  101  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0827849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2738  hypothetical protein  35.8 
 
 		 259 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.305966  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1222  hypothetical protein  36.72 
 
 		 256 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.371276  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4089  hypothetical protein  34.54 
 
 		 280 aa  98.2  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.0383988 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4420  hypothetical protein  29.21 
 
 		 720 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>