28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2563 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2563  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  351  2.9999999999999997e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00285487  hitchhiker  0.0000000213199 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1757  phage tail protein  68.64 
 
 		 169 aa  261  3e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657496 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1129  hypothetical protein  67.46 
 
 		 169 aa  259  8e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1826  phage tail protein  53.05 
 
 		 166 aa  189  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1504  hypothetical protein  54.55 
 
 		 174 aa  181  6e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0862  hypothetical protein  51.76 
 
 		 176 aa  173  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0831  hypothetical protein  48.48 
 
 		 174 aa  161  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1823  phage tail protein  47.9 
 
 		 171 aa  160  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0757  hypothetical protein  29.29 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1873  phage tail region protein  28.95 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0761  hypothetical protein  29.53 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00269614  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0976  hypothetical protein  28.67 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1505  hypothetical protein  35.42 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1502  hypothetical protein  26.97 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1959  hypothetical protein  35.71 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3151  phage tail protein  28.08 
 
 		 142 aa  52.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2895  hypothetical protein  32.46 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1561  phage tail protein  26.71 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5254  hypothetical protein  24.83 
 
 		 147 aa  48.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600416 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0846  hypothetical protein  26.79 
 
 		 154 aa  47.8  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4343  hypothetical protein  24.11 
 
 		 141 aa  47.8  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0471416  normal  0.110764 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0680  hypothetical protein  24 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0656  hypothetical protein  25.89 
 
 		 154 aa  45.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1658  phage tail protein  26 
 
 		 146 aa  44.7  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664664  normal  0.0320443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2822  phage tail protein  25.33 
 
 		 146 aa  44.7  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3817  phage tail protein  24.32 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0125737  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3661  hypothetical protein  22.88 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0365523  hitchhiker  0.000649304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2939  hypothetical protein  27.61 
 
 		 146 aa  41.6  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>