67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2464 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2464  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  329  9e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0371  phage tail protein  47.95 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3005  hypothetical protein  44.44 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3152  phage tail protein  46.48 
 
 		 148 aa  130  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0672  hypothetical protein  41.96 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3612  phage tail region protein  43.66 
 
 		 147 aa  125  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0679  hypothetical protein  42.07 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1040  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.26 
 
 		 148 aa  116  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1685  hypothetical protein  41.26 
 
 		 145 aa  115  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2547  conserved hypothetical phage tail protein  40.97 
 
 		 147 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5253  hypothetical protein  39.46 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00063173 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2820  phage tail protein  39.29 
 
 		 142 aa  101  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1660  phage tail protein  40 
 
 		 142 aa  91.7  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274017  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1873  phage tail region protein  35.66 
 
 		 146 aa  90.9  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3924  hypothetical protein  36.11 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000187514  hitchhiker  0.00829413 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3661  hypothetical protein  33.09 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0365523  hitchhiker  0.000649304 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3006  hypothetical protein  33.8 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3613  phage tail region protein  35.46 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436246 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0757  hypothetical protein  33.11 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1039  hypothetical protein  35.42 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5254  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600416 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0979  hypothetical protein  35.97 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.965809  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3151  phage tail protein  31.21 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4343  hypothetical protein  32.88 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0471416  normal  0.110764 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2465  hypothetical protein  32.87 
 
 		 152 aa  77  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.325818 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0680  hypothetical protein  30.61 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2190  hypothetical protein  33.11 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.376817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1502  hypothetical protein  31.72 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1505  hypothetical protein  31.69 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2895  hypothetical protein  29.17 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0673  hypothetical protein  29.17 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1420  hypothetical protein  29.17 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3923  hypothetical protein  32.62 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000169175  hitchhiker  0.00880657 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0976  hypothetical protein  31.47 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2822  phage tail protein  30.65 
 
 		 146 aa  67  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0372  phage tail protein  32.23 
 
 		 152 aa  67  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1658  phage tail protein  29.84 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664664  normal  0.0320443 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2943  hypothetical protein  29.41 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159813  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4345  hypothetical protein  28.57 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0854635  normal  0.111661 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26560  conserved hypothetical phage tail region protein  33.06 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00415635  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1561  phage tail protein  28.69 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0656  hypothetical protein  30.99 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2993  hypothetical protein  27.7 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0846  hypothetical protein  30.99 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1957  hypothetical protein  30 
 
 		 178 aa  62  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1055  hypothetical protein  28.93 
 
 		 160 aa  62  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1959  hypothetical protein  36.36 
 
 		 147 aa  62  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1686  hypothetical protein  29.08 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2546  conserved hypothetical phage tail protein  29.08 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0802  conserved hypothetical phage tail protein  28.19 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.286471 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1904  hypothetical protein  27.66 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0753341  hitchhiker  0.00215477 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1881  hypothetical protein  31.08 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0472148  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3820  phage tail protein  27.97 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0449238  normal  0.0664032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4388  hypothetical protein  25.42 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5386  hypothetical protein  28.47 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3037  phage tail protein  31.51 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000349431 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2265  hypothetical protein  25.36 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.000466935 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1728  conserved hypothetical phage tail protein  23.46 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000263815 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3039  phage tail protein  28.77 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000483158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0928  phage tail protein  27.12 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0917106  normal  0.176994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1630  conserved hypothetical phage tail protein  24.06 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105626 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0761  hypothetical protein  27.34 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00269614  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1743  conserved hypothetical phage tail protein  21.64 
 
 		 194 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1423  hypothetical protein  28.29 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1077  hypothetical protein  23.65 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1879  hypothetical protein  25 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0889335  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0862  hypothetical protein  23.45 
 
 		 176 aa  41.6  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1019  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>