17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1132 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1132  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  140  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1131  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  140  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6025  hypothetical protein  76.09 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0542451  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0307  hypothetical protein  64.91 
 
 		 67 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.382865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0560  hypothetical protein  77.27 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0999  hypothetical protein  71.43 
 
 		 76 aa  68.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0960019  normal  0.768182 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2638  hypothetical protein  54.69 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.730347  normal  0.81918 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1000  hypothetical protein  64.58 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204036  normal  0.73621 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1001  hypothetical protein  64.58 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.473211  normal  0.738354 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2783  hypothetical protein  56.52 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00277795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2343  hypothetical protein  59.52 
 
 		 61 aa  51.6  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.534452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2344  hypothetical protein  50 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3609  hypothetical protein  40.35 
 
 		 83 aa  45.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1623  hypothetical protein  35.48 
 
 		 292 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.597244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1927  hypothetical protein  42.31 
 
 		 192 aa  43.9  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.375799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0559  hypothetical protein  60.61 
 
 		 73 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6219  hypothetical protein  57.14 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.530764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>