52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3313 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3313  hypothetical protein  100 
 
 
351 aa  677    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4359  hypothetical protein  43.1 
 
 
358 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2221  hypothetical protein  47.2 
 
 
361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2562  hypothetical protein  39.88 
 
 
346 aa  199  6e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4945  hypothetical protein  34.03 
 
 
343 aa  179  8e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000030592  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2232  hypothetical protein  35.31 
 
 
349 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1876  hypothetical protein  35.65 
 
 
385 aa  172  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0643  hypothetical protein  33.43 
 
 
357 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05130  uncharacterized membrane protein  35.22 
 
 
335 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1518  hypothetical protein  30 
 
 
363 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.913415  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2507  transporter  36.68 
 
 
341 aa  142  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0517711 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1870  hypothetical protein  29.82 
 
 
346 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0416915  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1824  hypothetical protein  29.82 
 
 
346 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2012  hypothetical protein  29.82 
 
 
346 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2046  hypothetical protein  29.82 
 
 
346 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00084703 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3295  hypothetical protein  29.24 
 
 
346 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.335957 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2091  hypothetical protein  29.53 
 
 
346 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.295909  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2125  hypothetical protein  29.53 
 
 
346 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.586239  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1840  hypothetical protein  29.53 
 
 
346 aa  137  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.406982  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0299  hypothetical protein  30.36 
 
 
356 aa  136  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23450  hypothetical protein  30.86 
 
 
351 aa  135  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000814469  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2884  hypothetical protein  25.96 
 
 
352 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2010  hypothetical protein  32.93 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129341  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2014  hypothetical protein  28.95 
 
 
346 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.85804  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1874  hypothetical protein  29.24 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163445  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1519  hypothetical protein  28.61 
 
 
347 aa  133  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1765  hypothetical protein  30.29 
 
 
346 aa  133  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0677  hypothetical protein  28.32 
 
 
355 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.202663  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0692  hypothetical protein  28.32 
 
 
355 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0235088  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2565  hypothetical protein  27.11 
 
 
350 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0167  hypothetical protein  32.07 
 
 
361 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.604308  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2710  hypothetical protein  29.13 
 
 
369 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210144  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1879  hypothetical protein  29.24 
 
 
357 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2248  hypothetical protein  29.82 
 
 
354 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.284315  normal  0.730008 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3490  hypothetical protein  29.53 
 
 
354 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0707746  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07920  uncharacterized membrane protein  33.52 
 
 
385 aa  118  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.279282  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0857  hypothetical protein  32.86 
 
 
354 aa  117  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.549671  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0081  hypothetical protein  28.08 
 
 
367 aa  113  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00405626  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0308  hypothetical protein  25.22 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1661  hypothetical protein  31.53 
 
 
348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2592  hypothetical protein  27.24 
 
 
359 aa  110  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2540  hypothetical protein  27.24 
 
 
359 aa  110  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0891  hypothetical protein  27.98 
 
 
347 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139319  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0471  hypothetical protein  27.51 
 
 
414 aa  94  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12490  uncharacterized membrane protein  25.78 
 
 
459 aa  86.3  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21530  uncharacterized membrane protein  26.74 
 
 
408 aa  84  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.198401  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25260  uncharacterized membrane protein  27.22 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.461148  normal  0.040821 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2079  hypothetical protein  25.71 
 
 
349 aa  82.8  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1461  hypothetical protein  26.37 
 
 
378 aa  63.2  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0143143  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1817  hypothetical protein  24.22 
 
 
396 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0108  hypothetical protein  26.4 
 
 
371 aa  58.5  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0108219  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1835  uncharacterized membrane protein  22.44 
 
 
326 aa  43.9  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>