18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2255 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2255  hypothetical protein  100 
 
 
74 aa  151  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0509  hypothetical protein  97.3 
 
 
74 aa  147  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000452038  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3085  hypothetical protein  72.97 
 
 
76 aa  120  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.246871  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4010  protein of unknown function DUF1659  41.89 
 
 
74 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.229704  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1793  hypothetical protein  40.85 
 
 
75 aa  60.8  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4707  protein of unknown function DUF1659  35.14 
 
 
74 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0109  hypothetical protein  39.68 
 
 
75 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0744922  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0470  protein of unknown function DUF1659  38.89 
 
 
73 aa  51.2  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0111  hypothetical protein  39.68 
 
 
75 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0116  protein of unknown function DUF1659  33.78 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.025482  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1666  hypothetical protein  35.62 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2868  protein of unknown function DUF1659  28.38 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3322  protein of unknown function DUF1659  33.78 
 
 
73 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0326  protein of unknown function DUF1659  28.38 
 
 
77 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2548  protein of unknown function DUF1659  27.03 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000472771  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0424  hypothetical protein  35.38 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2355  protein of unknown function DUF1659  29.73 
 
 
74 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.260331  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0754  hypothetical protein  33.8 
 
 
74 aa  40.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>