12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3252 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_3252  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  342  1e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00156633  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1326  hypothetical protein  32.19 
 
 
154 aa  87  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.486859  normal  0.0795456 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1518  hypothetical protein  26.75 
 
 
167 aa  58.2  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.614963  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2431  hypothetical protein  32.43 
 
 
168 aa  49.3  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2796  hypothetical protein  26.28 
 
 
179 aa  47.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.434133  normal  0.0812431 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0307  hypothetical protein  32.5 
 
 
135 aa  45.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.341519 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0753  hypothetical protein  29.93 
 
 
172 aa  45.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.590626 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0752  conserved repeat domain-containing protein  34.57 
 
 
897 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.389587  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4950  hypothetical protein  27.81 
 
 
180 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.483082 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24760  conserved repeat protein  27.5 
 
 
1516 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.216781 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2434  hypothetical protein  33.33 
 
 
200 aa  41.6  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5945  hypothetical protein  27.88 
 
 
213 aa  40.4  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.310759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>