15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2917 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2917  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  642    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0283  hypothetical protein  43.87 
 
 
318 aa  268  7e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2292  hypothetical protein  25.5 
 
 
354 aa  88.6  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00375634  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2574  hypothetical protein  33.99 
 
 
354 aa  86.3  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.751723  normal  0.790758 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1554  hypothetical protein  33.33 
 
 
354 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.869352  normal  0.0586282 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1321  hypothetical protein  23.59 
 
 
380 aa  65.9  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.977063  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0931  hypothetical protein  24.57 
 
 
380 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2780  hypothetical protein  26.7 
 
 
397 aa  53.9  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4026  hypothetical protein  28.5 
 
 
397 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1544  hypothetical protein  26.38 
 
 
402 aa  48.9  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.885517  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1467  hypothetical protein  26.57 
 
 
402 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4578  hypothetical protein  26.94 
 
 
397 aa  48.5  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0570  hypothetical protein  25 
 
 
398 aa  47  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23466  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2348  hypothetical protein  28 
 
 
398 aa  45.8  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.231215  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3811  hypothetical protein  25.96 
 
 
396 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.569688 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>