86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2163 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  100 
 
 		 181 aa  363  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  35.58 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  33.1 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0658  Protein of unknown function DUF2062  35.29 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2390  hypothetical protein  29.81 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.194438  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2626  hypothetical protein  30.84 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1768  hypothetical protein  38.95 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254976  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2676  hypothetical protein  30.3 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1703  hypothetical protein  30.3 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1666  hypothetical protein  30.3 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.257609  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2586  hypothetical protein  35.79 
 
 		 169 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.757893  normal  0.0816334 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2804  hypothetical protein  35.79 
 
 		 169 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1681  hypothetical protein  30.3 
 
 		 169 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2494  hypothetical protein  35.79 
 
 		 169 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.101154 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2424  hypothetical protein  35.79 
 
 		 169 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.433268  normal  0.183637 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1555  hypothetical protein  29.81 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1778  hypothetical protein  38.64 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01852  flagellar biosynthesis protein FlhF  36.17 
 
 		 174 aa  67  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1335  hypothetical protein  28.48 
 
 		 169 aa  67  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  31.65 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  28.87 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1471  hypothetical protein  33.94 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2201  hypothetical protein  38.04 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1817  hypothetical protein  32.65 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392533  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1729  hypothetical protein  26.88 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.817068 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2671  hypothetical protein  41.57 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1643  Protein of unknown function DUF2062  28.82 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  37.23 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0609  hypothetical protein  29.29 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  28.87 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  26.06 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0898  hypothetical protein  31.43 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2507  hypothetical protein  30.52 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.792495  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2123  hypothetical protein  30.93 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  26.51 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  29.49 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  29.33 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  36.28 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  46.48 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0790  hypothetical protein  29.73 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0872806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0784  hypothetical protein  35 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2828  hypothetical protein  28.67 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  35.71 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0737  membrane protein  35.23 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  27.89 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3294  hypothetical protein  27.06 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.943309  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1636  hypothetical protein  27.63 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.687372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  27.21 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3130  hypothetical protein  30.15 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  33.9 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003989  hypothetical protein  29.63 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  27.14 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01533  hypothetical protein  28.7 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  31.63 
 
 		 180 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  30.85 
 
 		 172 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2833  hypothetical protein  32.63 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0982426  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0390  hypothetical protein  29.46 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.371828  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2731  hypothetical protein  35.54 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  35.45 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1989  hypothetical protein  34.88 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1362  hypothetical protein  24.17 
 
 		 171 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2062  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3864  uncharacterized protein-like protein  30.3 
 
 		 160 aa  52.4  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0502  hypothetical protein  36.76 
 
 		 210 aa  51.2  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000282211 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  30.43 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3780  uncharacterized protein-like protein  32.94 
 
 		 160 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0161725  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0526  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.983156  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  23.35 
 
 		 397 aa  48.9  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1399  hypothetical protein  40 
 
 		 218 aa  47.8  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1701  hypothetical protein  28.83 
 
 		 177 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2630  hypothetical protein  40.28 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662517  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2575  hypothetical protein  36.59 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0291416 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1671  hypothetical protein  37.8 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0658  hypothetical protein  40.28 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381208  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4133  hypothetical protein  28.7 
 
 		 160 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000340149  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0304  hypothetical protein  37.8 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.785913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0651  hypothetical protein  40.28 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.849018  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0515  hypothetical protein  27.83 
 
 		 191 aa  45.1  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838084  normal  0.7935 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0195  hypothetical protein  30.65 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0515  hypothetical protein  36.25 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2870  hypothetical protein  34.29 
 
 		 208 aa  42.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163842 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1214  hypothetical protein  27.08 
 
 		 188 aa  41.6  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1133  hypothetical protein  29.91 
 
 		 228 aa  41.2  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3779  hypothetical protein  32.95 
 
 		 159 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1583  hypothetical protein  32.71 
 
 		 178 aa  41.2  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0557  hypothetical protein  32.63 
 
 		 171 aa  40.8  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.235942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>