17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0394 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0394  GH3 auxin-responsive promoter  100 
 
 		 547 aa  1132    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.20196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2824  auxin-responsive GH3-related protein  35.58 
 
 		 487 aa  209  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0537258  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4770  GH3 auxin-responsive promoter  31.55 
 
 		 581 aa  196  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0973169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4515  GH3 auxin-responsive promoter  32.21 
 
 		 526 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0740  auxin-responsive GH3-related protein  32.43 
 
 		 532 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0953  GH3 auxin-responsive promoter  21.9 
 
 		 586 aa  92.4  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0561894  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1675  GH3 auxin-responsive promoter  24.31 
 
 		 559 aa  87.8  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2150  hypothetical protein  23.21 
 
 		 509 aa  67.4  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2176  hypothetical protein  24.15 
 
 		 509 aa  63.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2981  GH3 auxin-responsive promoter  21.54 
 
 		 557 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2698  GH3 auxin-responsive promoter  23.29 
 
 		 417 aa  55.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0752  GH3 auxin-responsive promoter  27.96 
 
 		 502 aa  46.2  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5924  GH3 auxin-responsive promoter  30.95 
 
 		 500 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0190  GH3 auxin-responsive promoter  29.76 
 
 		 495 aa  44.7  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.210438  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3178  GH3 auxin-responsive promoter  27.06 
 
 		 510 aa  44.7  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5651  GH3 auxin-responsive promoter  30 
 
 		 507 aa  43.5  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1720  hypothetical protein  23.63 
 
 		 509 aa  43.5  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>