25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_834 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0961  hypothetical protein  91.12 
 
 		 350 aa  669    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_834  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  724    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.245563  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0852  hypothetical protein  96 
 
 		 350 aa  701    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.358911  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1780  Protein of unknown function DUF128  40.56 
 
 		 330 aa  253  3e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1076  hypothetical protein  37.58 
 
 		 323 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1647  hypothetical protein  37.85 
 
 		 324 aa  228  8e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0669  hypothetical protein  36.79 
 
 		 314 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00126018  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0526  hypothetical protein  34.49 
 
 		 317 aa  180  4e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.312307 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2259  hypothetical protein  31.56 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1751  hypothetical protein  37.92 
 
 		 252 aa  176  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000678533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0291  Ribonuclease R winged-helix domain protein  32.08 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0321782  normal  0.500611 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1504  hypothetical protein  35.42 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0555  ribonuclease R winged-helix domain-containing protein  30.6 
 
 		 322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.10645  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1479  hypothetical protein  33.11 
 
 		 536 aa  155  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.711072  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0285  hypothetical protein  34.82 
 
 		 536 aa  152  7e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1629  hypothetical protein  34.5 
 
 		 536 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0999  hypothetical protein  34.5 
 
 		 536 aa  150  5e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.51453  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0218  hypothetical protein  33.65 
 
 		 545 aa  146  5e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1203  Protein of unknown function DUF128  32.05 
 
 		 250 aa  143  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.991646 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1470  hypothetical protein  32.26 
 
 		 271 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.284851  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2327  hypothetical protein  31.12 
 
 		 248 aa  135  8e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.808055 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0488  hypothetical protein  31.17 
 
 		 248 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.105289  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2599  hypothetical protein  27.23 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1790  Ribonuclease R winged-helix domain protein  25.87 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152362  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1785  Ribonuclease R winged-helix domain protein  27.08 
 
 		 374 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>