11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_526 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_526  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  276  6e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000558785  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0587  hypothetical protein  98.57 
 
 
140 aa  274  3e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0561  hypothetical protein  89.29 
 
 
140 aa  244  3e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00605837  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2519  hypothetical protein  30.67 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0110304 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1214  hypothetical protein  32 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000175016  normal  0.800065 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4062  hypothetical protein  30.71 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3352  hypothetical protein  30.95 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2642  hypothetical protein  33.04 
 
 
137 aa  47  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0735  hypothetical protein  33.73 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0333  hypothetical protein  33.64 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00389128  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06880  hypothetical protein  27.55 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>