15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1658 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1658  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  437  9.999999999999999e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.105631 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08671  hypothetical protein  35.44 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1429  hypothetical protein  40.85 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.115199  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2471  hypothetical protein  29.88 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1164  hypothetical protein  42.19 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2373  hypothetical protein  35.76 
 
 
217 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0116  Protein of unknown function DUF2302  34.97 
 
 
199 aa  64.3  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.129915  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1832  hypothetical protein  28.4 
 
 
285 aa  58.5  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0910711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2629  hypothetical protein  37.32 
 
 
172 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3952  hypothetical protein  31.62 
 
 
195 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.202628  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5302  hypothetical protein  32.33 
 
 
177 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  30 
 
 
417 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2835  hypothetical protein  36.18 
 
 
222 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105158  normal  0.245011 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2324  Calcium-binding EF-hand-containing protein  36.18 
 
 
222 aa  48.1  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0303  hypothetical protein  26.83 
 
 
303 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>