16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1339 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1339  hypothetical protein  100 
 
 
432 aa  865    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1148  hypothetical protein  30.18 
 
 
408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.159501 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1372  hypothetical protein  28.57 
 
 
407 aa  110  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.856108  normal  0.0265653 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1929  hypothetical protein  28.62 
 
 
510 aa  67.8  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.696713  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3680  hypothetical protein  25.65 
 
 
506 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2711  hypothetical protein  24.46 
 
 
474 aa  57.4  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0217  hypothetical protein  24.78 
 
 
397 aa  54.7  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1514  hypothetical protein  24.47 
 
 
476 aa  53.1  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.721483  normal  0.922529 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2690  hypothetical protein  24.51 
 
 
498 aa  50.4  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0138  hypothetical protein  24.74 
 
 
469 aa  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000720067  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1763  hypothetical protein  24.77 
 
 
501 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0676  hypothetical protein  26.22 
 
 
454 aa  47.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0973  hypothetical protein  26.67 
 
 
485 aa  47  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.442051  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2788  hypothetical protein  25.76 
 
 
484 aa  44.3  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1912  hypothetical protein  25.43 
 
 
484 aa  43.9  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398652  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2583  hypothetical protein  23.66 
 
 
463 aa  43.5  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0198931 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>