19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0746 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0746  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  275  1e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4139  hypothetical protein  37.25 
 
 		 152 aa  84.3  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.24606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4463  hypothetical protein  39.22 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235508  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0815  hypothetical protein  37.91 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351939 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0181  hypothetical protein  40.82 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000752164  normal  0.677539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6869  hypothetical protein  29.2 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.640003  normal  0.119892 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0023  hypothetical protein  43.24 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3775  hypothetical protein  33.09 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0018527  hitchhiker  0.00917662 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3661  hypothetical protein  29.41 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0897  hypothetical protein  27.86 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141206 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2548  hypothetical protein  31.43 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5793  hypothetical protein  29.87 
 
 		 154 aa  60.1  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2059  hypothetical protein  34.42 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.535372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2555  hypothetical protein  28.99 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3253  hypothetical protein  29.01 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0930132 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1779  hypothetical protein  34.42 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155662  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0737  hypothetical protein  27.94 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1159  hypothetical protein  25.49 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4171  hypothetical protein  29.17 
 
 		 147 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000102963  hitchhiker  0.000000290643 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>