13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0637 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0637  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 266 aa  519  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0665  tetratricopeptide TPR_4  33.2 
 
 		 244 aa  105  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1540  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.913508 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0994  hypothetical protein  31.71 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.391943 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0859  Tetratricopeptide TPR_4  27.82 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0924  Tetratricopeptide TPR_4  27.02 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.638112  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4035  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4769  hypothetical protein  27.59 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.365157 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3734  hypothetical protein  26.72 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2498  hypothetical protein  28.93 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0034451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1986  putative transmembrane protein  26.23 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.878282 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1662  tetratricopeptide TPR_4  29.27 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.399527  normal  0.999134 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 		 804 aa  43.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>