46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3419 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3419  GH3 auxin-responsive promoter  100 
 
 		 504 aa  1053    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3685  GH3 auxin-responsive promoter  58.33 
 
 		 502 aa  648    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.46637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5651  GH3 auxin-responsive promoter  63.67 
 
 		 507 aa  715    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3670  auxin-regulated protein  57.52 
 
 		 504 aa  624  1e-177  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1338  hypothetical protein  52.99 
 
 		 508 aa  585  1e-166  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0752  GH3 auxin-responsive promoter  53.89 
 
 		 502 aa  578  1e-164  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0869  GH3 auxin-responsive promoter  52.49 
 
 		 510 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1713  GH3 auxin-responsive promoter  49.8 
 
 		 507 aa  540  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00655  putative plant auxin-regulated protein  50.1 
 
 		 484 aa  526  1e-148  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1720  hypothetical protein  45.82 
 
 		 509 aa  474  1e-132  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1025  GH3 auxin-responsive promoter  35.67 
 
 		 494 aa  338  9.999999999999999e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0190  GH3 auxin-responsive promoter  35.57 
 
 		 495 aa  332  1e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.210438  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5924  GH3 auxin-responsive promoter  39.02 
 
 		 500 aa  332  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3178  GH3 auxin-responsive promoter  36.14 
 
 		 510 aa  329  8e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2048  GH3 auxin-responsive promoter  36.24 
 
 		 497 aa  323  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02895  putative auxin-regulated protein  36.36 
 
 		 497 aa  323  5e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380392  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3833  GH3 auxin-responsive promoter  37.8 
 
 		 500 aa  322  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723154  normal  0.130127 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0468  hypothetical protein  35.83 
 
 		 502 aa  307  3e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2997  auxin-regulated protein  35.97 
 
 		 496 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0949  GH3 auxin-responsive promoter  34.43 
 
 		 514 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.424251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0805  auxin-responsive GH3-related protein  34.43 
 
 		 514 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1664  GH3 auxin-responsive promoter  33.06 
 
 		 514 aa  283  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.714218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0473  GH3 auxin-responsive promoter  33.47 
 
 		 521 aa  282  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0144  GH3 auxin-responsive promoter  33.67 
 
 		 522 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2660  auxin-regulated like  32.88 
 
 		 512 aa  269  1e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1029  GH3 auxin-responsive promoter  33.47 
 
 		 510 aa  259  9e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00063016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0118  GH3 auxin-responsive promoter  29.75 
 
 		 508 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.086469 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0617  GH3 auxin-responsive promoter  30.57 
 
 		 528 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12318  hypothetical protein  29.28 
 
 		 507 aa  223  7e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1092  GH3 auxin-responsive promoter family protein  30.36 
 
 		 562 aa  211  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0359437  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1478  GH3 auxin-responsive promoter  29.49 
 
 		 527 aa  209  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.173313 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1855  GH3 auxin-responsive protein  31.27 
 
 		 530 aa  209  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2573  GH3 auxin-responsive promoter  30.77 
 
 		 539 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0495  GH3 auxin-responsive promoter  28.46 
 
 		 528 aa  201  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal  0.527563 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2981  GH3 auxin-responsive promoter  23.98 
 
 		 557 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0953  GH3 auxin-responsive promoter  24.48 
 
 		 586 aa  101  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0561894  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4770  GH3 auxin-responsive promoter  23.11 
 
 		 581 aa  74.3  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0973169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1675  GH3 auxin-responsive promoter  30.65 
 
 		 559 aa  64.3  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0740  auxin-responsive GH3-related protein  31.07 
 
 		 532 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4515  GH3 auxin-responsive promoter  28 
 
 		 526 aa  53.5  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1542  hypothetical protein  28.41 
 
 		 128 aa  53.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1190  GH3 auxin-responsive promoter  20.16 
 
 		 543 aa  51.2  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.259231  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2176  hypothetical protein  31.01 
 
 		 509 aa  50.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2150  hypothetical protein  31.01 
 
 		 509 aa  50.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1160  hypothetical protein  20.56 
 
 		 543 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.104088  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2824  auxin-responsive GH3-related protein  31.33 
 
 		 487 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0537258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>