21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3253 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3253  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  279  8.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0930132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1159  hypothetical protein  55.71 
 
 		 144 aa  144  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0737  hypothetical protein  45.31 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3775  hypothetical protein  35.66 
 
 		 155 aa  91.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0018527  hitchhiker  0.00917662 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3661  hypothetical protein  35.62 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4171  hypothetical protein  47.93 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000102963  hitchhiker  0.000000290643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6869  hypothetical protein  36.18 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.640003  normal  0.119892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4139  hypothetical protein  36.81 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.24606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2548  hypothetical protein  38.62 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0897  hypothetical protein  35.86 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5793  hypothetical protein  33.1 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0396  hypothetical protein  34.07 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02620  hypothetical protein  39.81 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2555  hypothetical protein  37.7 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2059  hypothetical protein  35.71 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.535372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0815  hypothetical protein  30.37 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351939 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4463  hypothetical protein  29.63 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235508  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0023  hypothetical protein  49.09 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0181  hypothetical protein  44.44 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000752164  normal  0.677539 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1779  hypothetical protein  34.29 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155662  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1109  hypothetical protein  34.31 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000177487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>